JELENA PLAVEC
Naslov: Molecular epidemiology of grapevine phytoplasma pathosystems: multilocus sequence typing approach
(Multigenska tipizacija i molekularna epidemiologija fitoplazmoza vinove loze)
Petak, 23. siječnja 2015. godine u 13,00 sati u Vijećnici Biološkog odsjeka, Prirodoslovno-matematičkog fakulteta, Rooseveltov trg 6, Zagreb
Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:
Izv. prof. dr. sc. Dijana Škorić, PMF Zagreb
Prof. dr. sc. Mirna Ćurković Perica, PMF Zagreb
Dr. sc. Marina Dermastia, znan. savj., National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology, Ljubljana, Slovenija
Zamjena: Dušica Vujaklija, viši znan. sur., IRB Zagreb
Mentor 1: Doc. dr. sc. Martina Šeruga Musić, PMF Zagreb
Mentor 2: Dr. sc. Xavier Foissac, zaslužni znanstvenik, INRA, France
Fitoplazme ('Candidatus Phytoplasma') su nekultivabilne bakterije bez stanične stjenke izrazito reduciranih genoma koje parazitiraju u floemu biljaka i stanicama kukaca. Gospodarski značajne bolesti žutica vinove loze (grapevine yellows; GY) uzrokuju fitoplazme ribosomskih skupina 16SrV (flavescence dorée; FD) i 16SrXII-A (stolbur; bois noir; BN,‘Candidatus Phytoplasma solani’). Iako su simptomi bolesti gotovo jednaki, ove fitoplazme se bitno razlikuju u epidemiologiji. Cilj ovog istraživanja bio je provesti multigensku tipizaciju izolata BN i FD fitoplazmi izoliranih iz zaraženih trsova vinove loze (Vitis vinifera L.), kukaca-vektora i korovnih biljaka s područja Hrvatske te pritom istražiti varijabilnost spomenutih izolata. Analizom gena tufB, vmp1, secY i stamp utvrđeno je čak sedamnaest različitih BN genotipova od čega tri genotipa zajedno obuhvaćaju više od polovice analiziranih izolata. Analizom gena map, secY, uvrB-degV i vmpA izolata fitoplazme FD utvrđene su dvije FD skupine. Ovo je prva i jedina multigenska karakterizacija izolata fitoplazme FD te ujedno prva detaljnija i opsežnija tipizacija izolata BN fitoplazme u Hrvatskoj. Rezultati dobiveni u sklopu ove disertacije pružili su dublji uvid u raznolikost i rasprostranjenost, te epidemiološki značaj pojedinih tipova izolata fitoplazmi vinove loze prisutnih na teritoriju Republike Hrvatske. Prikupljeni molekularni podaci omogućili su usporedbu podataka sa studijama drugih zemalja i ukazali na mogući put unosa patogena.
Pristupačnost