AZRA FRKATOVIĆ - OBRANA DOKTORSKOG RADA

Naslov:

Genome-wide association study of the human immunoglobulin G N-glycome

 (Cjelogenomska asocijacijska studija N-glikoma ljudskog imunoglobulina G)

Utorak, 05. srpanj 2022. u 16,00 sati u Vijećnici Biološkog odsjeka PMF-a, Rooseveltov trg 6, Zagreb

Povjerenstvo za obranu:

Prof. dr. sc. Olga Gornik Kljaić, Farmaceutsko-biokemijski fakultet, Zagreb

Dr. sc. Lucija Klarić, znanstvena suradnica, Institute of Genetics and Cancer, The University of Edinburgh, Velika Britanija

Prof. dr. sc. Kristian Vlahoviček, PMF Zagreb

Zamjena: izv. prof. dr. sc. Aleksandar Vojta, PMF, Zagreb

Mentor 1: prof. dr.sc. Gordan Lauc, Farmaceutsko-biokemijski fakultet, Sveučilište u Zagrebu

Mentor 2: dr. sc. Frano Vučković, znan.sur., Genos d.o.o., Zagreb

Sažetak:

Glikozilacija imunoglobulina G (IgG) je kompleksna postranslacijska modifikacija koje utječe na stabilnost IgG-a i njegove efektorske funkcije. U sklopu navedenog doktorskog rada, provedena je cjelogenomska asocijacijska studija N-glikanskih svojstava ljudskog IgG-a u sedam skupina ispitanika europskog podrijetla s ciljem otkrivanja novih genomskih regija povezanih s glikozilacijom IgG-a. Testirani fenotipovi definirani su kao postotak prisutnosti dane jedinice šećera u ukupnom IgG glikomu. Početna meta-analiza identificirala je 42 statistički značajna lokusa, od kojih je 13 novotokrivenih. Prioritiziranje gena mapiranih u otkrivenim regijama rezultiralo je s 83 gena koja su obogaćena u skupovima vezanim za stanični transport, razvoj B i T stanica te imunološki sustav, što sugerira da pored regulacije ekspresije gena za glikoenzime, unutarstanični transport i klonska selekcija i proliferacija oblikuju glikoprofil ljudskog IgG-a. Rezultati ove studije predstavljaju osnovu za funkcionalne studije kako bi se potvrdila uloga prioritiziranih gena u N-glikozilaciji.

Glycosylation of the immunoglobulin G (IgG) is a complex biosynthetic process that affects protein stability and effector functions. In this doctoral project, genome-wide association study of IgG N-glycan traits in seven cohorts of European descent was conducted to discover genomic regions associated with IgG glycosylation. The tested phenotypes were defined as the percentage of presence of individual sugar units in the total IgG glycome. Discovery meta-analysis resulted in 42 genome-wide significant loci, 13 of which were novel. Prioritization of the genes mapped in the associated regions resulted in 83 candidate genes which are enriched in cellular transport, B and T cell development and immune system, suggesting that not only the regulation of glycoenzyme gene expression but intracellular transport and clonal selection and proliferation shape the IgG glycopatterns. The findings provide the basis for functional studies to confirm the role of prioritized genes in IgG N-glycosylation.