Zvanje: | viši asistent |
Lokacija: | 301/ZBK |
Telefon: | +385 1 4606 233 |
Telefon kućni: | 6233 |
E-mail: | |
Osobna stranica na Webu: | http://gruic.chem.pmf.unizg.hr/people/phd/#zanki |
Zavod/služba: | Zavod za biokemiju |
Godina diplomiranja: | 2016. |
Godina doktoriranja: | 2022. |
Na zavodu od: | 2017. |
preddiplomski
diplomski
integrirani preddiplomski i diplomski
Vladimir Zanki završio je diplomski studij molekularne biologije (2016.) na Prirodoslovno-matematičkom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu. Diplomski rad pod naslovom Analiza proteinskih interakcija citosolne seril-tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana izradio je na Zavodu za biokemiju pod mentorstvom doc. dr. sc. Jasmine Rokov Plavec i neposrednim vodstvom dr. sc. Maria Kekeza.
Od siječnja 2017. zaposlen je kao asistent na Zavodu za molekularnu biologiju Biološkog odsjeka PMF-a, od studenog 2017. kao asistent, a od siječnja 2023. kao viši asistent na Zavodu za biokemiju Kemijskog odsjeka PMF-a. Doktorski studij kemije, smjer Biokemija, upisao je 2018. godine na Prirodoslovno-matematičkom fakultetu. Doktorsku disertaciju izradio je pod mentorstvom prof. dr. sc. Ite Gruić Sovulj, te obranio 2022. godine.
U svom znanstvenom radu bavi se istraživanjem aminoacil-tRNA-sintetaza, s naglaskom na povezanost između točnosti i efikasnosti translacije i antibiotske rezistencije. Kao modelne organizme koristi bakterije roda Bacillus, a u radu koristi suvremene metode molekularne biologije i bioinformatike, enzimske kinetike i proteinske biokemije.
Sudjeluje u izvođenju seminarske i praktikumske nastave iz biokemijskih kolegija za studente preddiplomskih i diplomskih studija PMF-a. Neposredni je voditelj jednog diplomskog rada.
Koautor je 5 znanstvenih radova koja indeksira baza Current Contents. Sudjelovao je na međunarodnim i domaćim znanstvenim skupovima s 14 posterskih priopćenja.
Dobitnik je Posebne rektorove nagrade za sudjelovanje na Noći biologije (2012.), te nagrade Fakultetskog vijeća PMF (2016.) za izvrstan uspjeh tijekom studija.
Napomena: Ove radove održava Knjižnica Instituta Ruđer Bošković koja vodi projekt Hrvatske znanstvene bibliografije CROSBI. Ovim linkom možete vidjeti sve podatke o radovima koje su autori unijeli u bazu podataka.
V. Zanki, B. Bozic, M. Mocibob, N. Ban, I. Gruic-Sovulj, A pair of isoleucyl-tRNA synthetases in Bacilli fulfills complementary roles to keep fast translation and provide antibiotic resistance, Protein Science, 31 (2022), e4418, doi: 10.1002/pro.4418
L. Pang, V. Zanki, S. V. Strelkov, A. Van Aerschot, I. Gruic-Sovulj, S. D. Weeks, Partitioning of the initial catalytic steps of leucyl-tRNA synthetase is driven by an active site peptide-plane flip, Communications Biology, 5 (2022) 883, doi: 10.1038/s42003-022-03825-8
M. Kekez, V. Zanki, I. Antičević, J. Rokov-Plavec, A. Maršavelski. Importance of protein intrinsic conformational dynamics and transient nature of non-covalent interactions in ligand binding affinity, International Journal of Biological Macromolecules, 192 (2021), 692-700, doi:10.1016/j.ijbiomac.2021.10.045
G. Josipović, V. Tadić, M. Klasić, V. Zanki, I. Bečeheli, F. Chung, A. Ghantous, T. Keser, J. Madunić, M. Bošković, G. Lauc, Z. Herceg, A. Vojta, V. Zoldoš. Antagonistic and synergistic epigenetic modulation using orthologous CRISPR/dCas9-based modular system, Nucleic Acids Research, 47 (2019), 9637-9657, doi:10.1093/nar/gkz709
M. Kekez, V. Zanki, I. Kekez, J. Baranašić, V. Hodnik, A.M. Duchêne, G. Anderluh, I. Gruić Sovulj, D. Matković-Čalogović, I. Weygand- Đurašević, J. Rokov Plavec. Arabidopsis seryl-tRNA synthetase: the first crystal structure and novel protein interactor of plant aminoacyl-tRNA synthetase, The FEBS journal, 286 (2019), 536-554