Vladimir Zanki, mag. biol. mol.

Nastava

preddiplomski

• Biokemija 2 (40884) - Vježbe u praktikumu
• Biokemija 2 (40884) - Seminar

diplomski

• Biokemija 2 (246006) - Vježbe u praktikumu
• Viši praktikum biokemije (44023) - Vježbe u praktikumu
• Biokemija 2 (246006) - Seminar

integrirani preddiplomski i diplomski

• Osnovni praktikum biokemije (196123) - Vježbe u praktikumu
• Praktikum biokemije (40769) - Laboratorijske vježbe
• Praktikum biokemije (40860) - Vježbe u praktikumu

Životopis

Vladimir Zanki završio je diplomski studij molekularne biologije (2016.) na Prirodoslovno-matematičkom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu. Diplomski rad pod naslovom Analiza proteinskih interakcija citosolne seril-tRNA-sintetaze iz biljke Arabidopsis thaliana izradio je na Zavodu za biokemiju pod mentorstvom doc. dr. sc. Jasmine Rokov Plavec i neposrednim vodstvom dr. sc. Maria Kekeza.

Od siječnja 2017. zaposlen je kao asistent na Zavodu za molekularnu biologiju Biološkog odsjeka PMF-a, od studenog 2017. kao asistent, a od siječnja 2023. kao viši asistent na Zavodu za biokemiju Kemijskog odsjeka PMF-a. Doktorski studij kemije, smjer Biokemija, upisao je 2018. godine na Prirodoslovno-matematičkom fakultetu. Doktorsku disertaciju izradio je pod mentorstvom prof. dr. sc. Ite Gruić Sovulj, te obranio 2022. godine.

U svom znanstvenom radu bavi se istraživanjem aminoacil-tRNA-sintetaza, s naglaskom na povezanost između točnosti i efikasnosti translacije i antibiotske rezistencije. Kao modelne organizme koristi bakterije roda Bacillus, a u radu koristi suvremene metode molekularne biologije i bioinformatike, enzimske kinetike i proteinske biokemije. 

Sudjeluje u izvođenju seminarske i praktikumske nastave iz biokemijskih kolegija za studente preddiplomskih i diplomskih studija PMF-a. Neposredni je voditelj jednog diplomskog rada.

Koautor je 5 znanstvenih radova koja indeksira baza Current Contents. Sudjelovao je na međunarodnim i domaćim znanstvenim skupovima s 14 posterskih priopćenja.

Dobitnik je Posebne rektorove nagrade za sudjelovanje na Noći biologije (2012.), te nagrade Fakultetskog vijeća PMF (2016.) za izvrstan uspjeh tijekom studija.

Objavljeni radovi u Hrvatskoj znanstvenoj bibliografiji (CROSBI)

Napomena: Ove radove održava Knjižnica Instituta Ruđer Bošković koja vodi projekt Hrvatske znanstvene bibliografije CROSBI. Ovim linkom možete vidjeti sve podatke o radovima koje su autori unijeli u bazu podataka.

Prikaži radove Za sve izmjene možete se obratiti na help@bib.irb.hr, a na istu adresu možete uputiti i sva vaša pitanja i sugestije vezana uz CROSBI.

Izabrane publikacije

V. Zanki, B. Bozic, M. Mocibob, N. Ban, I. Gruic-Sovulj, A pair of isoleucyl-tRNA synthetases in Bacilli fulfills complementary roles to keep fast translation and provide antibiotic resistance, Protein Science, 31 (2022), e4418, doi: 10.1002/pro.4418

L. Pang, V. Zanki, S. V. Strelkov, A. Van Aerschot, I. Gruic-Sovulj, S. D. Weeks, Partitioning of the initial catalytic steps of leucyl-tRNA synthetase is driven by an active site peptide-plane flip, Communications Biology, 5 (2022) 883, doi: 10.1038/s42003-022-03825-8

M. Kekez, V. Zanki, I. Antičević, J. Rokov-Plavec, A. Maršavelski. Importance of protein intrinsic conformational dynamics and transient nature of non-covalent interactions in ligand binding affinity, International Journal of Biological Macromolecules, 192 (2021), 692-700, doi:10.1016/j.ijbiomac.2021.10.045

G. Josipović, V. Tadić, M. Klasić, V. Zanki, I. Bečeheli, F. Chung, A. Ghantous, T. Keser, J. Madunić, M. Bošković, G. Lauc, Z. Herceg, A. Vojta, V. Zoldoš. Antagonistic and synergistic epigenetic modulation using orthologous CRISPR/dCas9-based modular system, Nucleic Acids Research, 47 (2019), 9637-9657, doi:10.1093/nar/gkz709

M. Kekez, V. Zanki, I. Kekez, J. Baranašić, V. Hodnik, A.M. Duchêne, G. Anderluh, I. Gruić Sovulj, D. Matković-Čalogović, I. Weygand- Đurašević, J. Rokov Plavec. Arabidopsis seryl-tRNA synthetase: the first crystal structure and novel protein interactor of plant aminoacyl-tRNA synthetase, The FEBS journal, 286 (2019), 536-554