Izvor financiranja: Hrvatska zaklada za znanost

Osnovni podaci o projektu

Trajanje: 15. 12. 2025. – 14. 12. 2028.

Voditelj projekta: izv. prof. dr. sc. Rosa Karlić

Sredstva: 199.985,00 EUR

Broj projekta: IP-2025-02-5581

Sažetak projekta

Osteosarkom, mezenhimski tumor s incidencijom od 4–5 slučajeva na milijun godišnje, prvenstveno pogađa adolescente i mlade odrasle. Dok je kemoterapija učinkovita za nemetastatske slučajeve, metastatska bolest ima nisku stopu preživljavanja od 20%. Ciljane terapije su ograničene zbog različitih temeljnih mutacija i visoke heterogenosti tumora, uzrokovane evolucijom različitih tumorskih klonova. Razumijevanje molekularnih mehanizama inicijacije i progresije tumora ključno je za poboljšanje liječenja, ali genomskih podataka o osteosarkomu, posebno na razini jedne stanice, nedostaje zbog njegove rijetkosti.

Naš cilj je primijeniti novi pristup za karakterizaciju genomskih profila uzoraka osteosarkoma i istraživanje evolucije tumora pod selektivnim pritiskom terapije. Procjenom uzoraka prikupljenih tijekom 20 godina, odabrat ćemo pacijente na temelju povijesti bolesti, liječenja i dostupnosti arhivskih uzoraka u trenutku dijagnoze, resekcije i recidiva. Sekvencirat ćemo do 20 genoma osteosarkoma prilikom dijagnoze kako bismo identificirali gene pokretače i mutacijske potpise uključene u karcinogenezu, istovremeno provodeći molekularnu potklasifikaciju.

Detaljno ćemo karakterizirati uzorke iz različitih faza progresije tumora kod 4–6 reprezentativnih pacijenata s osteosarkomom iz različitih podtipova. Cjelogenomsko sekvenciranje bit će korišteno za praćenje klonalne ekspanzije povezane s otpornošću na liječenje i recidivom, dok će analiza prostorne transkriptomike omogućiti razlučivanje pojedinih populacija stanica i njihovih različitih transkriptomskih profila.

Ove prostorne i vremenske analize razotkrit će heterogenost i evoluciju tumora, dinamiku neoantigena i promjene u mikrookruženju. Istražit ćemo i mehanizme otpornosti na lijekove i prilagodbe izazvane terapijom, pružajući okvir za unapređenje precizne onkologije i poboljšanje tretmana. Ovo će biti prvi skup podataka te vrste za osteosarkom, koji nudi jedinstvene uvide u njegovu molekularnu sliku i terapijske izazove.

Projektni tim