VEDRAN FRANKE
Naslov: Evolution and function of rodent specific MT transposons (Evolucija i funkcija traspozona MT specifičnih za glodavce)
Petak, 18. ožujka 2016. godine u 16,00 sati u Seminaru Zavoda za molekularnu biologiju Biološkog odsjeka Prirodoslovno-matematičkog fakulteta, Horvatovac 102a, Zagreb
Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:
Doc. dr. sc. Nenad Malenica, PMF Zagreb
Dr. sc. Helena Ćetković, viša znan. sur., IRB Zagreb
Petr Svoboda, PhD, Group leader, Laboratory of Epigenetic Regulations, Institute of Molecular Genetics of the ASCR, Prague
Zamjena: Doc. dr. sc. Damjan Franjević, PMF Zagreb
Mentor: Prof. dr. sc. Kristian Vlahoviček, PMF Zagreb
Retrotranspozoni MT pripadaju klasi LTR retrotranspozona, prisutnih isključivo kod glodavaca. Nakon retrotranspozona SINE i LINE, MT elementi su treći najučestaliji ponavljajući elementi u genomima glodavaca. Za razliku od klasičnih LTR retrotranspozona sisavaca, sekvenca između LTR krajeva kod MT elemenata nije homologna retroviralnim GAG, POL i PRO proteinima, već sadržava niz regulatornih sekvenci. One MT elementima omogućavaju tkivno - specifično reprogramiranje transkriptoma a time i doprinos u regulaciji genske ekspresije. MT elementi dijele se u pet skupina, MTA – MTE. MTC element u intronu 6 gena Dicer 1, stvara oocitno specifičnu, skraćenu izoformu proteina – nazvanu DicerO. Takav skraćeni protein pokazuje veću procesivnost malih interferirajućih RNA molekula (siRNA) u usporedbi sa somatskom izoformom proteina, DicerS. Ciljano uklanjanje elementa MTC iz introna 6 gena Dicer 1 ima za posljedicu poremećaje u organizaciji diobenog vretena i sterilnost ženki miševa, iz čega proizlazi da je MTC element esencijalni dio genoma miša. U ovom radu opisao sam podrijetlo, širenje i funkcionalnu ulogu (funkciju) retrotranspozona MT u liniji glodavaca.
Pristupačnost