Analize podataka u biološkim istraživanjima

Repozitorij

Anketa

Na ovoj stranici trenutno nije odabrana niti jedna anketa!

Analize podataka u biološkim istraživanjima

Šifra: 253569
ECTS: 6.0
Nositelji: izv. prof. dr. sc. Rosa Karlić
izv. prof. dr. sc. Toni Safner
izv. prof. dr. sc. Anamaria Štambuk
Izvođači: dr. sc. Lucija Kanjer - Vježbe u praktikumu
Prijava ispita: Studomat
Opterećenje:

1. komponenta

Vrsta nastaveUkupno
Predavanja 30
Vježbe u praktikumu 45
* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)
Opis predmeta:
Ovaj predmet kreiran je za jačanje kompetencija studenata za razumijevanje i provođenje bioloških istraživanja. Gledanje na biološke podatake kao varijable omogućuje ne samo primjerene analize, testiranje hipoteza, nego i pravilan dizajn istraživanja. Kroz mnogobrojne biološke primjere i manje setove podataka studenti će dobiti praktično znanje i razumijevanje prikupljanja i analize podataka. Vježbe se održavaju u R-u, ali se kroz dovoljno vremena i u malim grupama omogućava savladavanje gradiva bez obzira na prethodno znanje ili računalne kompetencije.
Cilj predmeta
Cilj predmeta je osposobiti studente za samostalne osnovne deskriptivne i statističke analize bioloških podataka u programskom okruženju R. Predmet pridonosi razvijanju kompetencija razumijevanja postavljanja i testiranja hipoteze, te odgovarajućeg dizajna eksperimenta i prikupljanja podataka u biološkim istraživanjima, identifikacije glavnih vrsta varijabli u takvim istraživanjima, kao i odabiru odgovarajućih vrsta deskriptivne i statističke analize prikupljenih podataka. Cilj predmeta je i osposobiti studente za izradu osnovnih grafičkih i tabličnih prikaza prikupljenih podataka i rezultata analiza, kao i interpretaciju biološke značajnosti dobivenih rezultata.
Sadržaj predmeta
Tipovi bioloških podataka i biološke varijable (pokus, uzorkovanje)
Proporcije i frekvencije, vjerojatnost u biološkim istraživanjima
Razdiobe podataka u biološkim istraživanjima
Deskriptivne analize i grafička vizualizacija bioloških podataka, mjerila centralne tendencije i mjerila varijabilnosti
Testiranje hipoteze u biološkim istraživanjima, nul hipoteza, uzorak i populacija, statistička i biološka značajnost
Parametrijska statistika bioloških podataka- pretpostavke, testovi, transformacije podataka
Pregled osnovnih statističkih analiza kategoričkih i numeričkih varijabli u biološkim istraživanjima
Regresije i korelacije, linearni modeli bioloških podataka
Eksperimentalni dizajn u biološkim istraživanjima, replikati, snaga testa, točnost i preciznost
Neparametrijska statistika bioloških podataka
Multivarijatne analize bioloških podataka
Vježbe prate nastavne cjeline i odvijaju se u okruženju R
Literatura:
  1. Dizajn eksperimenata "S primjenom u poljoprivredi", Jerko Gunjača, Agronomski fakultet i Znanstveni centar izvrsnosti za bioraznolikost i molekularno oplemenivanje bilja.
  2. The Analysis of Biological Data, Michael Whitlock and Dolph Schluter, Roberts and Company Publishers.
1. semestar
Izborni kolegiji - Redovni Studij - Znanosti o okolišu

3. semestar
Izborni kolegiji - Redovni - Botanika
Izborni kolegiji - Redovni Studij - Ekologija i zaštite prirode
Izborni kolegiji - Redovni - Fiziologija i imunobiologija
Izborni kolegiji - Redovni Studij - Molekularna biologija
Izborni kolegiji - Redovni Studij - Znanosti o okolišu
Izborni kolegiji - Redovni - Zoologija
Termini konzultacija:

Drage kolegice i dragi kolege, 

bodovi ostvareni na drugom kolokviju te zaključne ocjene su objavljene u sustavu, trebali bi ih dobiti e-mailom. Uvidi u drugi kolokvij biti će u ponedjeljak u 10 sati u praktikumu 8P1 (Trg Marka Marulića 20). Ukoliko ste zadovoljni ocjenom, prijavite ispitni rok  za 11.2. i upisat ću vam ocjenu.

Ukoliko niste zadovoljni ocjenom možete pristupiti ispitu (ovim putem vas želim i ohrabriti za taj korak).

Za rok 11.2. pošaljite mail na adrese astambuk@biol.pmf.hr i lucija.kanjer@biol.pmf.hr do ponedjeljka 9. veljače u 13 sati.

Poslat ćemo vam projektni zadatak (sličan drugom kolokviju), te ćete imati 24 sata da ga riješite i pošaljete rješenja. Usmeni ispit će se održati u srijedu 11.2. od 10 sati u predavaonici ZOAKS (023) na Kemijskom odsjeku (Horvatovac 102a). Na usmenom ispitu ću vam postaviti pitanja vezana za provedene postupke u projektnom zadatku, te interpretaciju rezultata.

Za rok 25.2 pošaljite mail na adrese astambuk@biol.pmf.hr i lucija.kanjer@biol.pmf.hr do ponedjeljka 23. veljače u 9.00 sati, procedura je ista, a usmeni ispit će biti u srijedu  25.02  od 10 sati u predavaonici ZOAKS (023) na Kemijskom odsjeku (Horvatovac 102a).

Ukoliko te srijede jutrom imate neke druge obaveze, ja ću imati ispite iz drugih kolegija cijelo prijepodne, pa se možemo dogovoriti da dođete nešto kasnije.

Lijep pozdrav

Anamaria

 

Autor: Anamaria Štambuk
Popis obavijesti