1. komponenta

Vrsta nastave	Ukupno
Predavanja	30
Seminar	30

Osnovni cilj kolegija je upoznati studente s temeljnim konceptima znanosti o mikrobiomima i suvremenim istraživanjima mikrobnih zajednica, osobito onih povezanih s biljnim i životinjskim domaćinima. Specifični ciljevi kolegija odnose se na predstavljanje suvremenih metoda analize mikrobioma i interakcija mikroorganizama, objašnjavanje molekularnih i funkcionalnih interakcija između domaćina i mikrobioma te razumijevanje uloge mikrobioma u prilagodbi i evoluciji višestaničnih organizama. Kolegij naglašava ulogu mikrobioma u razvojnim, fiziološkim i ekološkim procesima te povezanost zdravlja okoliša, biljaka, životinja i ljudi u okviru holističkog pristupa Jedno zdravlje

PREDAVANJA:

Osnovni pojmovi i metode:

1. Uvod u znanost o mikrobiomima: osnovni pojmovi, terminologija, povijesni razvoj koncepta i promjena paradigme na znanstvenom i društvenom nivou; Metode u istraživanjima mikrobioma: strategije uzorkovanja, problemi s kontaminacijom, sekvenciranje amplikona, metagenomika, metatranskriptomika, metaproteomika i interpretacija osnovnih podataka
2. Interakcije domaćina i mikroorganizama: Molekularne, metaboličke i signalne interakcije
Mikrobiom čovjeka i izgrađenog okoliša
3. Razvoj, evolucija i ekologija ljudskog mikrobioma
4. Ljudski mikrobiom: mitovi i miskoncepcije i recentni pravci istraživanja
5. Ljudski mikrobiom: disbioza i povezanost s bolestima
6. Urbani mikrobiom i mikrobiomi izgrađenog okoliša
7. Građanska znanost u istraživanjima mikrobioma
Mikrobiomi životinja
8. Životinje kao domaćini evolucija i ekologija mikrobioma morskih i terestričkih sisavaca
9. Mikrobiomi kralješnjaka - ribe, vodozemci, gmazovi, ptice
10. Mikrobiomi beskralješnjaka (spužve, koralji, meduze, rakovi, kukci)
Mikrobiomi biljaka
11. Biljni mikrobiomi: rizosfera, filosfera, endosfera
12. Mikrobiomi algi i morskih cvjetnica
Mikrobiom okoliša i koncept Jedno Zdravlje
13. Povezanost hrane i crijevnog mikrobioma, tla, mikrobioma biljaka u okviru pristupa ?Jedno zdravlje?
14. Koncept Jedno zdravlje: divlji mikrobiomi i antimikrobna rezistencija
15. Kako istraživanja mikrobioma mogu spasiti planet u konketstu klimatskih promjena, zagađenja, gubitka biodiverziteta, otpornosti ekosustava te budući pravci istraživanja

SEMINAR:

Tijekom semestra studenti izrađuju seminarski rad iz odabrane teme iz područja znanosti o mikrobiomima. Seminar je potrebno prezentirati te ga rade u grupama čija je veličina prilagođena ovisno o broju studenata upisanih na kolegij.
Seminarske teme se osvježavaju i ponuđene su ovisno o novim spoznajama i pravcima istraživanja. Nakon izloženog seminara, održava se rasprava i evaluacija komunikacijskih vještina te procjena uspješnosti studenata u izradi seminarskog rada. U sklopu seminarske nastave predviđene su također i kritičke diskusije tema u obliku radionica koje su pokrivene u sklopu nastavnih jedinica na predavanjima.

1. "Microbiomes: Health and the Environment", https://mavmatrix.uta.edu/oer_mavsopenpress/24 Odabrana poglavlja koja prate sadržaj kolegija, Parks, Dylan, Mavs Open Press Open Educational Resources., 2022.
2. Microbiomes: A Very Short Introduction, Odabrana poglavlja koja prate sadržaj kolegija, Douglas, A.E.,, Oxford University Press., 2022.

Izborni kolegiji - Redovni Studij - Molekularna biologija