1. komponenta

Vrsta nastave	Ukupno
Predavanja	30
Vježbe u praktikumu	15
Seminar	15

* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)

ISHODI UČENJA:
1. Objasnitii fizikalne temelje difrakcije na kristalu.
2. Objasniti metode određivanja kristalne strukture proteina.
3. Izvesti eksperiment kristalizacije proteina.
4. Primijeniti osnovne metode rješavanja i utočnjavanja struktura proteina.
5. Koristiti se bazama riješenih struktura bioloških makromolekula.

PREDAVANJA:
1. Makroskopska svojstva kristala.
2. Osnove simetrije u kristalima; Millerovi indeksi, točkine grupe.
3. Kristalne rešetke.
4. Prostorne grupe.
5. Osnovni principi difrakcije na monokristalima; Braggov zakon
6. Metode kristalizacije proteina.
7. Izvori i detektori rentgenskog zračenja.
8. Fourierova sinteza; problem faza.
9. Metode sakupljanja difrakcijskih podataka.
10. Proteinske baze podataka.
11. Osnovne metode određivanja kristalne strukture proteina.
12. Izrada modela i utočnjavanje strukture
13. Analiza riješene strukture.

SEMINAR:
Samostalno rješavanje, utočnjavanje, analiziranje i vizualizacija dodijeljene strukture biološke makromolekule i prezentiranje rješenja.

VJEŽBE:
1. Kristalizacija odabranog proteina metodom difuzije para u visećoj kapi.
2. Odabir kristala i sakupljanje difrakcijskih podataka.
3. Procesiranje podataka i rješavanje kristalne strukture odabrane biološke makromolekule korištenjem metode molekulske zamjene.
4. Utočnjavanje kristalne strukture odabrane biološke makromolekule.
5. Analiza i vizualizacija strukture odabrane biološke makromolekule.

1. Biomolecular Crystallography: Principles, Practice, and Application to Structural Biology, Bernard Rupp, New York, Garland Science, 2009.
2. Fundamentals of Crystallography,, Carmelo Giacovazzo (ed.), Carmelo Giacovazzo, Hugo Luis Monaco, Gilberto Artioli, Davide Viterbo, Marco Milanesio, Gastone Gilli, Paola Gilli, Giuseppe Zanotti, Giovanni Ferraris, Michele Catti, 3rd Ed, Oxford University Press, 2011.
3. Principles of Protein X-Ray Crystallography, Jan Drenth, 3rd Ed, Springer, 2007.
4. Crystal Structure Determination, W. Clegg, Oxford University Press, Oxford, 2002.

Izborni kolegiji - Strukturna biologija - Redovni Studij - Molekularna biologija