Tinka Vidović

Obrana će se održati u petak 12. srpnja 2024. godine u 11.00 sati u dvorani ZMB Seminar,  PMF, Horvatovac 102a, Zagreb

Disertacija nosi naslov: Bioinformatička analiza učinka stanične parabioze i genske ekspresije na nastanak i metastaziranje tumoraBioinformatic analysis of influence of cellular parabiosis and gene expression on tumorigenesis and metastasis formation

Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:

1. izv. prof. dr. sc. Rosa Karlić, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
2. prof. dr. sc. Nada Oršolić, red. prof. u trajnom izboru, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
3. naslovni doc. dr. sc. Petar Ozretić, znan. suradnik, Institut Ruđer Bošković, Zagreb

Zamjena:  naslovni izv. prof. dr. sc. Tomislav Domazet- Lošo, Institut Ruđer Bošković, Zagreb

Mentor: akademik Miroslav Radman, MedILS, Mediteranski institut za istraživanje života, Split

Sažetak:

U ovom radu se istražio utjecaj stanične parabioze i genske ekspresije na specifičnost nastanka tumora. Pokazali smo da tkiva koja povećano izražavaju gene koje pripadaju kategorijama nedostatak IRAK4 te MET aktivira Rap1 i Rac1 su podložnija nastanku metastazi. Navedeni rezultat je u skladu s početnom hipotezom da se manipulacijom staničnom parabiozom mogu spriječiti maligni tumori budući da su Rho-GTPaze regulatori aktinskog citoskeleta i stanične migracije. Koristeći metodu ponderirane genske koekspresije pronađeni su ključni geni za nastanak tumora, koji su se usporedili s normalnom ekspresijom gena u svim tkivima. Cilj ove analize je bio vidjeti kako su ključni geni u tumorima izraženi u svim normalnim tkivima, budući da obrazac ekspresije gena u normalnom tkivu može biti uzrok specifičnosti metastaziranja. Također su pronađeni i diferencijalno eksprimirani (DE) geni između ranih i kasnih stadija, te se na temelju ekspresije DE gena postignuti odlični rezultati razlikovanja ranih i kasnih stadija tumora metodom potpornih vektora.