O djelatniku

dr. sc. Boris Gomaz

Radno mjesto: stručni suradnik
Funkcija: Suradnik na projektu
Lokacija: 224
Telefon:+385 1 4606 151
E-mail: E-mail
Zavod/služba: Zavod za fizikalnu kemiju
Godina diplomiranja:2021.
Godina doktoriranja:2025.

Životopis

Dr. sc. Boris Gomaz, mag. chem. doktorirao je 2025. godine na Institutu Ruđer Bošković pod mentorstvom dr. sc. Zorana Štefanića, s disertacijom usmjerenom na dinamiku i alosteričku regulaciju enzima fosforilaze purinskih nukleozida iz bakterije Helicobacter pylori. Disertacija i rezultati dio su istraživačkog projekta Alosterički komunikacijski putevi u oligomernim enzimima (IP-2019-04-6764). Rezultati istraživanja objavljeni su u međunarodnim časopisima Journal of Chemical Information and Modeling i Symmetry, a predstavljeni na više domaćih i međunarodnih znanstvenih skupova. U dva je navrata, u ukupnom trajanju od pet mjeseci, boravio na Brunel University London (UK) u sklopu projekata Hrvatske zaklade za znanost i programa HPC-Europa3, gdje je provodio dodatnu izobrazbu i istraživanja.

Trenutno je zaposlen kao suradnik na projektu MI-DNA DISC (Horizon Europe) na Zavodu za fizikalnu kemiju Prirodoslovno-matematičkog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu, pod vodstvom prof. dr. sc. Branimira Bertoše, gdje se bavi simulacijama molekulske dinamike membranskih sustava i DNA.

Njegovi istraživački interesi uključuju računalnu biofiziku, dinamiku biomolekula, alosteriju, obradu i vizualizaciju velikih skupova biokemijskih podataka te razvoj računalnih alata za analizu strukture i dinamike proteina, s naglaskom na integraciju naprednih simulacijskih i analitičkih metoda u biokemijska istraživanja.

CroRIS

From Motion to Communication: Tracking Allosteric Networks in Purine Nucleoside Phosphorylase

Gomaz, Boris; Pandini, Alessandro; Maršavelski, Aleksandra; Štefanić, Zoran
neobjavljeni prilog sa skupa, 2025.

Oligomeric Symmetry of Purine Nucleoside Phosphorylases

Gomaz, Boris; Štefanić, Zoran
izvorni znanstveni rad, 2024.
Symmetry (Basel)

How Python helped us uncover secrets of protein motion

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
neobjavljeni prilog sa skupa, 2024.

Computational analysis of purine nucleoside phosphorylase dynamics

Gomaz, Boris; Pandini, Alessandro; Maršavelski, Aleksandra; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, Hot Topics in Contemporary Crystallography 6 (HTCC 6) - Advanced macromolecular crystallography workshop: Programme Book, 2024.

MDavocado: Analysis and Visualization of Protein Motion by Time-Dependent Angular Diagrams

Gomaz, Boris; Pandini, Alessandro; Maršavelski, Aleksandra; Štefanić, Zoran
izvorni znanstveni rad, 2024.
Journal of chemical information and modeling

Deciphering dynamics of purine nucleoside phosphorylase

Gomaz, Boris ; Pandini, Alessandro ; Maršavelski, Aleksandra ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, 8th Faculty of Science PhD Student Symposium: Book of Abstracts, 2024.

Potraga za alosterijom kod proteina upotrebom napredne vizualizacije

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, Srce DEI 2023 Knjiga sažetaka, 2023.

Allosteric Communication in Enzymes Through Advanced Visualization of MD Simulations

Štefanić, Zoran; Maršavelski, Aleksandra; Gomaz, Boris;
sažetak izlaganja sa skupa, Computational Chemistry Day 2023 : Book of Abstracts, 2023.

Allostery in Purine Nucleoside Phosphorylases Revealed by a Combination of Protein Crystallography and Molecular Dynamics Simulations

Maršavelski, Aleksandra; Gomaz, Boris; Štefanić, Zoran
izvorni znanstveni rad, 16th International Symposium on Biocatalysis & Biotransformations ; book of abstract and book of posters, 2023.

Understanding allostery in oligomeric enzymes through big data visualization

Gomaz, Boris ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, The Twenty-ninth Slovenian-Croatian Crystallographic Meeting : book of abstracts and programme, 2023.

Exploring the structural and dynamic data

Štefanić, Zoran; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, Hot Topics in Contemporary Crystallography 5 Experimental Advances in Macromolecular Crystallography, 2023.

Oligomeric symmetry of purine nucleoside phosphorylases

Gomaz, Boris ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, The Twenty-eighth Croatian-Slovenian Crystallographic Meeting : Book of Abstracts, 2022.

Understanding allostery in purine nucleoside phosphorylases by machine learning and molecular dynamics interaction databases

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, ECM33 book of abstracts, 2022.

Search for the similarities in the crystal structures of purines as possible inhibitors of purine nucleoside phosphorylase from Helicobacter pylori

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, EPDiC17 : Book of Abstracts, 2022.

Search for Allostery in Purine Nucleoside Phosphorylases via Database of Molecular Interactions

Štefanić, Zoran ; Maršavelski, Aleksandra ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, The Twenty-eighth Croatian-Slovenian Crystallographic Meeting : Book of Abstracts, 2022.

Structure comparison and structural alignments of oligomeric purine nucleoside phosphorylases

Gomaz, Boris ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, Solutions in Chemistry Book of Abstracts, 2022.

Kristalizacija derivata inzulina

Gomaz, Boris ; Kekez, Ivana ; Matković-Čalogović, Dubravka ; Prugovečki, Biserka
sažetak izlaganja sa skupa, Knjiga sažetaka, 2020.
Detaljno o radovima