O djelatniku

dr. sc. Boris Gomaz

Zvanje: stručni suradnik
Funkcija:Suradnik na projektu
Lokacija: 224
Telefon:+385 1 4606 151
E-mail: E-mail
Zavod/služba: Zavod za fizikalnu kemiju
Godina diplomiranja:2021.
Godina doktoriranja:2025.

Životopis

Dr. sc. Boris Gomaz, mag. chem. doktorirao je 2025. godine na Institutu Ruđer Bošković pod mentorstvom dr. sc. Zorana Štefanića, s disertacijom usmjerenom na dinamiku i alosteričku regulaciju enzima fosforilaze purinskih nukleozida iz bakterije Helicobacter pylori. Disertacija i rezultati dio su istraživačkog projekta Alosterički komunikacijski putevi u oligomernim enzimima (IP-2019-04-6764). Rezultati istraživanja objavljeni su u međunarodnim časopisima Journal of Chemical Information and Modeling i Symmetry, a predstavljeni na više domaćih i međunarodnih znanstvenih skupova. U dva je navrata, u ukupnom trajanju od pet mjeseci, boravio na Brunel University London (UK) u sklopu projekata Hrvatske zaklade za znanost i programa HPC-Europa3, gdje je provodio dodatnu izobrazbu i istraživanja.

Trenutno je zaposlen kao suradnik na projektu MI-DNA DISC (Horizon Europe) na Zavodu za fizikalnu kemiju Prirodoslovno-matematičkog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu, pod vodstvom prof. dr. sc. Branimira Bertoše, gdje se bavi simulacijama molekulske dinamike membranskih sustava i DNA.

Njegovi istraživački interesi uključuju računalnu biofiziku, dinamiku biomolekula, alosteriju, obradu i vizualizaciju velikih skupova biokemijskih podataka te razvoj računalnih alata za analizu strukture i dinamike proteina, s naglaskom na integraciju naprednih simulacijskih i analitičkih metoda u biokemijska istraživanja.

CroRIS

From Motion to Communication: Tracking Allosteric Networks in Purine Nucleoside Phosphorylase

Gomaz, Boris; Pandini, Alessandro; Maršavelski, Aleksandra; Štefanić, Zoran
neobjavljeni prilog sa skupa, 2025.

MDavocado: Analysis and Visualization of Protein Motion by Time-Dependent Angular Diagrams

Gomaz, Boris; Pandini, Alessandro; Maršavelski, Aleksandra; Štefanić, Zoran
izvorni znanstveni rad, 2024.
Journal of chemical information and modeling

Computational analysis of purine nucleoside phosphorylase dynamics

Gomaz, Boris; Pandini, Alessandro; Maršavelski, Aleksandra; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, Hot Topics in Contemporary Crystallography 6 (HTCC 6) - Advanced macromolecular crystallography workshop: Programme Book, 2024.

How Python helped us uncover secrets of protein motion

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
neobjavljeni prilog sa skupa, 2024.

Oligomeric Symmetry of Purine Nucleoside Phosphorylases

Gomaz, Boris; Štefanić, Zoran
izvorni znanstveni rad, 2024.
Symmetry (Basel)

Deciphering dynamics of purine nucleoside phosphorylase

Gomaz, Boris ; Pandini, Alessandro ; Maršavelski, Aleksandra ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, 8th Faculty of Science PhD Student Symposium: Book of Abstracts, 2024.

Exploring the structural and dynamic data

Štefanić, Zoran; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, Hot Topics in Contemporary Crystallography 5 Experimental Advances in Macromolecular Crystallography, 2023.

Understanding allostery in oligomeric enzymes through big data visualization

Gomaz, Boris ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, The Twenty-ninth Slovenian-Croatian Crystallographic Meeting : book of abstracts and programme, 2023.

Potraga za alosterijom kod proteina upotrebom napredne vizualizacije

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, Srce DEI 2023 Knjiga sažetaka, 2023.

Allosteric Communication in Enzymes Through Advanced Visualization of MD Simulations

Štefanić, Zoran; Maršavelski, Aleksandra; Gomaz, Boris;
sažetak izlaganja sa skupa, Computational Chemistry Day 2023 : Book of Abstracts, 2023.

Oligomeric symmetry of purine nucleoside phosphorylases

Gomaz, Boris ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, The Twenty-eighth Croatian-Slovenian Crystallographic Meeting : Book of Abstracts, 2022.

Search for the similarities in the crystal structures of purines as possible inhibitors of purine nucleoside phosphorylase from Helicobacter pylori

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, EPDiC17 : Book of Abstracts, 2022.

Search for Allostery in Purine Nucleoside Phosphorylases via Database of Molecular Interactions

Štefanić, Zoran ; Maršavelski, Aleksandra ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, The Twenty-eighth Croatian-Slovenian Crystallographic Meeting : Book of Abstracts, 2022.

Understanding allostery in purine nucleoside phosphorylases by machine learning and molecular dynamics interaction databases

Štefanić, Zoran ; Gomaz, Boris
sažetak izlaganja sa skupa, ECM33 book of abstracts, 2022.

Structure comparison and structural alignments of oligomeric purine nucleoside phosphorylases

Gomaz, Boris ; Štefanić, Zoran
sažetak izlaganja sa skupa, Solutions in Chemistry Book of Abstracts, 2022.

Kristalizacija derivata inzulina

Gomaz, Boris ; Kekez, Ivana ; Matković-Čalogović, Dubravka ; Prugovečki, Biserka
sažetak izlaganja sa skupa, Knjiga sažetaka, 2020.
Detaljno o radovima