PROJECT AARS SUBSTRATE AND EDITING SPECIFICITY

Trajanje / Duration: 1.3.2019. – 28.2.2022.

Financiranje / Funding: Hrvatska zaklada za znanost i Švicarska nacionalna zaklada za znanost / Croatian Science Foundation and Swiss National Science Foundation (a bilateral Croatian-Swiss project)

VODITELJI PROJEKTA / PRINCIPAL INVESTIGATORS: prof. dr. sc. Ita Gruić Sovulj, prof. Nenad Ban

INSTITUCIJE KOJE SUDJELUJU U PROJEKTU / INSTITUTIONS

Prirodoslovno-matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu / Faculty of Science, University of Zagreb

ETH Zurich

Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel

NAZIV PROJEKTA / PROJECT TITLE

Investigation of substrate and editing specificity in tRNA synthetases and the mechanism of antibiotic action

SAŽETAK / ABSTRACT

PROJEKTNI TIM / PROJECT TEAM

Prirodoslovno-matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu: Ita Gruić Sovulj, Vladimir Zanki, Alojzije Brkić, Bartol Božić, Aleksandra Maršavelski

ETH Zurich: Nenad Ban, Marc Leibundgut

Weizmann Institute of Science: Dan Tawfik

PUBLIKACIJE / PUBLICATIONS

1. V. Zanki, B. Bozic, M. Mocibob, N. Ban, I. Gruic-Sovulj, A pair of isoleucyl-tRNA synthetases in Bacilli fulfills complementary roles to keep fast translation and provide antibiotic resistance, Pro Sci 31 (2022) e4418, doi: 10.1002/pro.4418

KONFERENCIJE / CONFERENCES

1. A. Brkić, B. Božić, M. Leibundgut, N. Ban, I. Gruić Sovulj, Novel insights into structural basis of antibiotic resistance in type II isoleucyl-tRNA synthetases, 5th Mini Symposium of Section of Medicinal and Pharmaceutical Chemistry, 30.11.2021., Zagreb, Hrvatska
2. A. Brkić, B. Božić, M. Leibundgut, N. Ban, I. Gruić Sovulj, Structure of a bacterial full­​-length type 2 IleRS reveals the C­​-terminal tRNA-binding domain insertion dispensable for aminoacylation, FEBS Congress: Molecules of Life: Towards new horizons, 3.-8.7.2021. Ljubljana, Slovenija (virtualno)
3. V. Zanki, B. Božić, I. Gruić Sovulj, Isoleucyl-tRNA synthetase carrying antibiotic resistance cannot support sporulation and biofilm formation in Bacillus megaterium, FEBS Congress: Molecules of Life: Towards new horizons, 3.-8.7.2021. Ljubljana, Slovenija (virtualno)
4. A. Brkić, M. Leibundgut, N. Ban, I. Gruić Sovulj, Structure of a bacterial full-length type 2 isoleucyl-tRNA synthetase reveals the C-terminal tRNA-binding domain, Virtual symposium celebrating the 50th anniversary of the Protein Data Bank, 4.-5.5.2021. USA (virtualno)
5. A. Brkić, M. Leibundgut, N. Ban, I. Gruić Sovulj, Novel insights into structural basis of antibiotic resistance in type II isoleucyl-tRNA synthetases, 5. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a, 24.-25.4.2021., Zagreb, Hrvatska 
6. V. Zanki, I. Gruić Sovulj, Izoleucil-tRNA-sintetaza tipa 1 presudna je za sporulaciju i nastanak biofilmova u bakteriji Bacillus megaterium, Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a, 28.2.2020., Zagreb, Hrvatska - nagrada za najbolje mikro-izlaganje
7. V. Zanki, I. Gruić Sovulj, Two distinct IleRS proteins in Bacillus megaterium and their possible roles in adaptation to various stress condition, HDBMB2019, Crossroads in Life Sciences, 25.-28.9.2019., Lovran, Hrvatska
8. V. Zanki, I. Gruić Sovulj, IleRS2 is responsible for mupirocin resistance of Bacillus megaterium, Bacell 2019, 9.-10.4.2019., Ljubljana, Slovenija
9. V. Zanki, I. Gruić Sovulj, Two IleRSs in Bacillus megaterium: is there a difference?, The 3rd COST-sponsored ARBRE-MOBIEU plenary meeting, 18.-20.3.2019., Zagreb, Hrvatska

OSTALE AKTIVNOSTI / OTHER ACTIVITIES

1. Rektorova nagrada: Kian Bigović Villi, Ekspresija izoleucil-tRNA-sintetaze otporne na mupirocin uslijed izloženosti bakterije Priestia megaterium različitim uvjetima neantibiotskog stresa, 2022, Kemijski odsjek, Prirodoslovno-matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu (Mentor: prof. dr. sc. Ita Gruić Sovulj, neposredni voditelj: Vladimir Zanki, mag. biol. mol.)
2. Diplomski rad: Bartol Božić, Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium, rujan 2020, Kemijski odsjek, Prirodoslovno-matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu (Mentor: prof. dr. sc. Ita Gruić Sovulj, neposredni voditelj: Vladimir Zanki, mag. biol. mol.)
3. Radni posjet. Alojzije Brkić boravi u laboratoriju prof. Nenada Bada na ETH Zurich (rujan-studeni 2020) gdje se usavršava u metodama proteinske kristalografije i krioelektronske mikroskopije
4. Radni posjet. Alojzije Brkić boravi u laboratoriju prof. Nenada Bada na ETH Zurich (veljača-ožujak 2020) gdje se usavršava u metodama proteinske kristalografije i krioelektronske mikroskopije.
5. Diplomski rad: Lucija Pavlak, Osjetljivost izoleucil-tRNA-sintetaza iz različitih organizama prema mupirocinu na proteinskoj i staničnoj razini, 2019, Kemijski odsjek, Prirodoslovno-matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu (Mentor: doc. dr. sc. Morana Dulić)