Istraživanje slatkovodnog raka iz porodice Astacidae rezultiralo novim rekordom u carstvu životinja

Studenti Biološkog odsjeka Ljudevit Luka Boštjančić, Lena Bonassin i Lucija Anušić u suradnji s profesorima (prof. dr. sc. Ivanom Maguire, prof. dr. sc. Višnjom Besendorfer, mag. biol. exp. Leonom Lovrenčić) i znanstvenicima iz Australije (prof. Christopher M. Austin, Deakin University), Francuske (prof. Frederic Grandjean, University of Poitiers) i Njemačke (Dr. Carola Greve i Dr. Alexander Ben Hamadou, LOEWE-TBG) pod mentorstvom dr. sc. Jelene Mlinarec objavili su rad u prestižnom časopisu Frontiers in Genetics.

Istraživanje genoma uskoškarog raka, Pontastacus leptodactylus  (Eschscholtz, 1823) je pokazalo da ova vrsta posjeduje najveći genom među ~640 opisanih vrsta slatkovodnih rakova nadporodice Astacoidea, čak 18,7 Gbp,  od čega 54,85% genoma zauzimaju ponavljajuće DNA. Genom ove vrste obiluje uzastopno ponavljajućim DNA iznimne raznolikosti. U uskoškarom raku opisano je čak 258 različitih porodica satelitske DNA što predstavlja najveći broj opisanih porodica satelitnih DNA među životinjskim i biljnim vrstama. Najzastupljenije porodice mapirane su na kromosome, a među njima je i prva (peri)centromerna satelitna porodica opisana u rakovima koja lokalizira s DAPI pozitivnim prugama na svim kromosomskim.
Istraživanja repetitoma ove ekonomski i ekološki vrijedne vrste otvara nove perspektive u istraživanju evolucije slatkovodnih rakova.

Više detalja na poveznici: Boštjančić LL, Bonassin L, Anušić L, Lovrenčić L, Besendorfer V, Maguire I, Grandjean F, Austin CM, Greve C, Hamadou AB and Mlinarec J (2021) The Pontastacus leptodactylus (Astacidae) Repeatome Provides Insight Into Genome Evolution and Reveals Remarkable Diversity of Satellite DNA. Front. Genet. 11:611745. doi: 10.3389/fgene.2020.611745

Zapratite projekt KarioAstacidae na Facebooku!