Opcije pristupačnosti Pristupačnost
Istraživanje prof. Zoldoš i njezina...

Prof. dr. sc. Vlatka Zoldoš i njezina grupa za epigenetiku s Biološkog odsjeka PMF-a, objavili su znanstveni rad “Antagonistic and synergistic epigenetic modulation using orthologous CRISPR/dCas9-based modula system” (Josipović G, Tadić V, et al. 20119) u renomiranom časopisu Nucleic Acids Research.

Ovaj je rad nastavak priče koja je objavljena u istom časopisu 2016. godine (Vojta, Dobrinić et al. 2016, NAR) u kojem je prvi puta vezan enzim DNA metiltransferaza de novo (DNMT3A) za inaktivni protien dCas9 te je ovaj molekularni alat upotrebljen za ciljano povećanje metilacije citozina u molekuli DNA. Bio je to veliki uspjeh grupe prof. Zoldoš jer je rad postigao zavidan status - ušao je među top 0.1% znanstvenih radova u akademskom području Biology&Biochemistry, te se službeno nalazio u skupini hot papers u srpnju/kolovozu 2016. godine na osnovu praga citiranosti.  

Grupa prof. dr. sc. Zoldoš ide dalje u svojim istraživanjima te za protein dCas9 vežu i druge epigenetičke modulatore, poput enzima TET1 za ciljanu demetilaciju molekule DNA te proteine KRAB i VPR za ciljano direktno utišavanje odnosno aktiviranje ekspresije gena. Novi modularni molekularni alat je poput lego kockica, odnosno moguće je složiti specifičnu konfiguraciju za specifičnu namjenu u samo nekoliko koraka. U radu se koristi se ovaj modularni sustav za epigenetičku manipulaciju ekspresije dva gena istovremeno u istoj stanici uz upotrebu ortogonalnih proteina dCas9 iz dvije različite bakterije, S. aureus i S. pyogenes. Kandidat geni manipulirani u ovom radu su oni odgovorni za glikozilaciju proteina te su autori demonstrirali kako je ciljanom promjenom CpG metilacije i posljedično genske ekspresije moguće promijeniti glikanski fenotip u animalnim stanicama u kulturi.

Istraživanje je u potpunosti provedeno u grupi za epigenetiku pod vodstvom prof. dr. sc. Vlatke Zoldoš i doc. dr. sc. A. Vojte, u Zavodu za molekularnu biologiju Biološkog odsjeka PMFa (osim analize glikana provedenog na Farmaceutsko-biokemijskom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu, te cjelogenomske analize metiloma, koja je provedena na IARCu).

Autor: webmaster BO
Popis obavijesti