Odobreno sufinanciranje znanstvenika Biološkog odsjeka u sklopu istraživačkih projekata slovensko-hrvatske bilateralne suradnje

Projekt Visokoprotočno Nanopore-sekvenciranje mikrobnih genoma u rješavanju problema dijagnostike i epidemiologije biljnih patogena  jedan je od osam odobrenih projekata u sklopu ovog natječaja. Cilj ovog projekta je korištenje nekoliko različitih sustava za uzgoj rajčice kao eksperimentalnih sustava za razvoj i poboljšanje Nanopore-tehnologije sekvenciranja visoke protočnosti (HTS) u otkrivanju složenih etiologija biljnih bolesti. Biljne bolesti često imaju etiologiju koja podrazumijeva interakciju nekoliko vrsta mikrobnih uzročnika bolesti. Kompleks uzročnika može uključivati jednu ili više vrsta virusa s različitim tipovima genoma (npr. dvolančani DNA, jednolančani RNA, dvolančani RNA), viroide (male kružne RNA kao biljne subvirusne patogene), ponekad i fitoplazme (bakterijski uzročnici) te njihove kombinacije. Divlje biljke izvan granica područja uzgoja rajčice bit će uključene u analize kao potencijalni rezervoarni domaćini uzročnika u okolišu. Osim toga, testirat će se voda za navodnjavanje za koju je zabilježeno da može poslužiti za rasprostranjivanje viroida, biljnih virusa i bakterija, ali još uvijek je to slabo istražen način prijenosa bolesti. Ovaj pristup trebao bi pružiti uvid u molekularnu epidemiologiju bolesti rajčice i ekologiju odabranih (agro)ekosustava. Istraživanje je dio širih projektnih aktivnosti slovenskih znanstvenika utemeljenih na najnovijim tehnologijama koje vodi prof. dr. sc. Maja Ravnikar s Nacionalnog inštituta za biologijo (NIB) u Ljubljani. 

Istraživanja u Hrvatskoj, osim voditeljice prof. dr. sc. Dijane Škorić, provodit će izv. prof. dr. sc. Martina Šeruga Musić, izv. prof. dr. sc. Antun Alegro i asistentica Marina Drčelić s Biološkog odsjeka PMF-a.