Dora Pavić - Obrana doktorskog rada

Naslov:

Molecular identification of freshwater pathogenic oomycetes and determination of novel factors that promote their spreading

Molekularna identifikacija slatkovodnih patogenih Oomycota i utvrđivanje novih čimbenika koji potiču njihovo rasprostranjivanje

Obrana rada održati će se u: 

Četvrtak, 06. travnja 2023. godine u 16.00 sati

u predavaonici BO6, PMF, Trg Marka Marulića 20, Zagreb

Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:

Prof. dr. sc. Ivana Maguire, PMF, Zagreb

Doc. dr. sc. Marin Ježić, PMF, Zagreb

Doc. dr. sc. Perla Tedesco, University of Bologna, Italija

Zamjena:  prof. dr. sc. Lidija Šver, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb

Mentor: izv. prof. dr. sc. Ana Bielen, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb

Abstract:

Aphanomyces astaci and Saprolegnia spp. are considered as the most destructive Oomycota pathogens of freshwater animals, both in natural habitats and in aquaculture, and this dissertation addressed several understudied aspects of their ecology. First, a highly sensitive S. parasitica-specific ddPCR assay was developed, which allowed absolute quantification of the pathogen in environmental DNA samples. Further, the results obtained provided information on the microbiological and physico-chemical properties of natural waters that favour the sporulation and spread of these pathogens, such as environmentally relevant concentrations of humic acids. Finally, the role of aquaculture facilities as points of spreading of Saprolegnia spp. into downstream freshwater environments was demonstrated. Overall, the knowledge gained provides the basis for sensitive monitoring and predicting the various factors that could promote the spread of A. astaci and Saprolegnia spp. in the wild and aquaculture.

Sažetak:
Aphanomyces astaci i Saprolegnia spp. najznačajniji su oomicetni patogeni slatkovodnih životinja, kako u prirodnim staništima tako i u akvakulturi. U sklopu ove disertacije dobivena su nova saznanja o nekim aspektima njihove ekologije. Najprije je razvijen visoko osjetljiv i specifičan ddPCR-test za detekciju vrste S. parasitica, čime je po prvi puta omogućena apsolutna kvantifikacija ovog patogena u uzorcima okolišne DNA. Nadalje, utvrđena su mikrobiološka i fizikalno-kemijska svojstva prirodnih voda koja potiču sporulaciju i širenje oomicetnih patogena, kao što je prisutnost huminskih kiselina u okolišno relevantnim koncentracijama. Naposlijetku, demonstrirana je uloga uzgajališta pastrve u širenju patogena Saprolegnia spp. u nizvodna prirodna staništa. Zaključno, rezultati ove disertacije omogućit će praćenje oomicetnih patogena u prirodnim slatkovodnim staništima i akvakulturi, kao i predviđanje različitih čimbenika koji potiču njihovo rasprostranjivanje.