Karlo Miškec - obrana doktorskog rada

Obrana će se održati u četvrtak, 18. siječnja 2024. u 11.00 sati u dvorani 2, BIOCENTAR, Borongajska cesta 83 H, Zagreb

Disertacija nosi naslov: Functional validation of genes associated with glycosylation of immunoglobulin G
Funkcionalna analiza gena povezanih s glikozilacijom imunoglobulina G

Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:

1. Prof. dr. sc. Vlatka Zoldoš, PMF, Zagreb
2. Prof. dr. sc. Dunja Leljak-Levanić, PMF, Zagreb
3. Prof. dr. sc. Gordan Lauc, Farmaceutsko-biokemijski fakultet

Zamjena: dr. sc. Maja Pučić-Baković, znan. savjetnik, Genos d.o.o.

Mentor: izv. prof. dr. sc. Aleksandar Vojta, PMF, Zagreb

THESIS SUMMARY:

Immunoglobulin G (IgG) is a key player in the human immune system. Pletohora of its roles is determined by its alternative N-glycosylation of Fc region, which has a role in defining its pro- or antiinflamatory character. Except Fc region, 20-25% of IgG molecules are glycosylated on the Fab region. Genome-wide association studies (GWAS) showed that IgG glycosylation is regulated by a complex gene network including genes with roles in immune cell development and immune response. However, role of these genes in IgG glycosylation is unknown. Therefore, twenty-three of GWAS hits were selected for functional validation in a model system FreeStyle™ 293-F with VPR-dSaCas9 and KRAB-dSpCas9 stably integrated in the genome. This system was modified for simultaneous analysis of Fab and Fc glycosylation followed by gene manipulation. Ten genes were functionally proven to be relevant for Fab and/or Fc glycosylation: KIF3C, MANBA, TNFRSF13B, EEF1A1, HIVEP2, TBX21, SPPL3, DERL2, RRBP1, and KDELR2.

SAŽETAK RADA:

Imunoglobulin G (IgG) jedan je od ključnih igrača u imunom sustavu čovjeka s velikim brojem različih uloga koje su određene altrernativnom N-glikozilacijom njegove Fc regije, uključujući njegovo proupalno ili protuupalno djelovanje. Izuzev regije Fc, 20-25% molekula IgG je glikozilirano na regiji Fab. Cjelogenomske studije povezanosti (engl. genome wide association studies, GWAS) su otkrile da je glikozilacija IgG-a regulirana kompleksnom mrežom gena koja uključuje gene s ulogom u razvoju imunoloških stanica i imunološkim odgovorima, čija uloga u IgG glikozilaciji nije poznata. Dvadesettri gena otkrivenih studijama GWAS odabrano je za funkcionalnu validaciju u staničnom modelu FreeStyle™ 293-F sa stabilno ugrađenim fuzijama VPR-dSaCas9 i KRAB-dSpCas9 za manipulaciju gena, a koji je modificiran u svrhu istovremene analize glikozilacije regija Fab i Fc. Rezultat ovog istraživanja otkriva deset gena (identificiranih studijama GWAS) s ulogom u Fab i/ili Fc glikozilacijskom putu: KIF3C, MANBA, TNFRSF13B, EEF1A1, HIVEP2, TBX21, SPPL3, DERL2, RRBP1 i KDELR2.