Izborni kolegiji s drugih studija, iste ili drugih sastavnica ili drugih sveučilišta upisuju se na temelju dogovora, preporuke i upute savjetnika, odnosno mentora, te ovise o temi istraživanja. Imaju za cilj ojačati znanja iz teme istraživanja, metodologije i tehnika istraživanja koja su potrebna, te poticati interdisciplinarnost i širinu pogleda. Izbor izbornih kolegija je u skladu s naglašeno individualnim pristupom razvoju svakog pojedinog kandidata.

Izborni kolegiji se biraju s bilo koje razine sveučilišnog studija i bilo kojeg sveučilišta – osim sa studija koji su kandidati završili. Kandidati koji su završili geografiju ne mogu birati izborni kolegij s geografije. Oni koji su završili neki drugi studij mogu upisati izborni kolegij s geografije. Na taj način se upisuju neophodni geografski kolegiji za njihovu temu istraživanja. Kandidat može sam predložiti izborni kolegij, ali ga ne može upisati bez savjetnikove/mentorove suglasnosti. Suglasnost se mora dobiti i od nositelja kolegija. Suglasnost  se potvrđuje potpisom na obrascu.

Najviše dva izborna kolegija tijekom studija moguće je zamijeniti za odgovarajuće ljetne škole, radionice gostujućih nastavnika ili slične oblike naobrazbe te putem mobilnosti studenta. Doktorandi dostavljaju Vijeću PDS-a zahtjev za priznavanje prije sudjelovanja na navedenim oblicima naobrazbe. Zahtjevu se prilaže satnica i  program radionice (ljetne škole, mobilnosti) te popis obveza koje se očekuju od sudionika (polaganje ispita, izrada projekta, pisanje seminara, provedeno istraživanje i sl.). Zahtjevu se prilaže i preporuka savjetnika/mentora za priznavanjem takve naobrazbe umjesto izbornog kolegija. Vijeće PDS-a na temelju Zahtjeva i dokumentacije odlučuje o priznavanju predloženog oblika naobrazbe kao zamjene za izborni kolegij.